这时廷臣交谏，攻魏忠贤的奏疏有数十通之多，有人劝叶向高趁此时下手，而叶向高有他自己的想法：

《明史·叶向高传》：

向高念忠贤未易除，阁臣从中挽回，犹冀无大祸，乃具奏称忠贤勤劳，朝廷宠待厚，盛满难居，宜解事权，听归私第，保全终始。

这已经是帮魏忠贤了，而魏忠贤不但不领情，且深为不快，矫旨驳复，连篇累牍都是称赞魏忠贤有功的话。这不是太监所能做的文章，一打听，出于阉党绍兴人徐大化的手笔。

魏忠贤那时虽又气又恨，想尽杀东林，但还怕外朝正臣讲话，不敢畅所欲为，但阉党知道那班正人君子和而不同，有可乘之机，极力煽动，于是魏忠贤放手大干了。

这年十月，借故驱逐了杨涟、左光斗等人，接着便是对付叶向高。